Το Πανεπιστημιακό Εκπαιδευτικό Κέντρο του Πανεπιστημίου Δυτικής Μακεδονίας αποτελείται από τα ακόλουθα Ινστιτούτα
Ανθρωπιστικών ερευνών
(Institute of Humanitarian research)
με έδρα την Φλώρινα
(Orliakas Educational Astronomical Park Institute)
με έδρα τα Γρεβενά
Ενεργειακής ανάπτυξης και μετάβασης στη μεταλιγνιτική εποχή
(Institute of Energy Development and Transition to Postlignite Era)
με έδρα την Κοζάνη
(Institute of Economic Analysis and Entrepreneurship)
με έδρα την Καστοριά